吉林大學排名比較好的學科有馬克思主義理論、化學、哲學、法學、政治學、考古學、數學、物理學、機械工程、計算機科學與技術等。

1、化學

吉林大學化學學院前身是吉林大學化學系，始建于1952年，由著名化學家蔡鎦生院士、唐熬慶院士、關實之教授、陶慰孫教授等人創建。2001年5月，新吉林大學進行院系整合，化學學院正式成立。作為我國重要的化學高級人才培養基地與科學研究中心，吉林大學化學學院師資力量雄厚，教育與科研設施先進，擁有無機合成與制備化學國家重點實驗室，超分子結構與材料教育部重點實驗室等七個國家級研究機構，在國內外享有良好的社會聲譽和較高的學術地位。不單單屬于國家重點學科，同時也是ESI排名入全球前1‰的學科。

2、車輛工程

吉林大學汽車工程學科成立于1955年，是由原交通大學、華中工學院和山東工學院的相關專業組建而成的，是國內汽車領域最早的國家級重點學科，學校師資里雄厚，擁有本行業唯一的工程院院士（郭孔輝院士）。教學設備先進，具有國家級重點實驗室（汽車動態模擬實驗室），在全國常年排名第一。在整車和底盤、動力和傳動的產品開發先進技術方面尤其有優勢，我中國汽車工業人才培養的搖籃和科學研究的重要基地，為中國一汽和全國汽車行業培養了大量優質人才。